目前,新型冠狀病毒肺炎(COVID-19)疫情嚴峻,截至4月8日,全球已累計確診近134萬例🛡,死亡超7萬🎐,對人類生存健康造成了嚴重的危害💥🐊。COVID-19是由新型冠狀病毒SARS-CoV-2感染導致的‼️,而感染者除了典型的肺炎等呼吸系統症狀外👫,還伴隨多組織多器官的其它多種症狀,其原因很可能是存在其它病原體的共感染或繼發感染。確定共感染的病原體類型與症狀之間的關系,對於對症治療和用藥指導尤為重要。但是,如何做到對臨床樣品中共感染的多種病毒👱🏻♂️、細菌和真菌等病原體同時進行快速、無偏向性的檢測呢?
意昂官网生命科學學院伊成器課題組新近發展的基於轉座酶的TRACE (Transposase assisted RNA/DNA hybrid Co-tagmEntation)建庫測序技術🌷,能夠快捷地檢測與新冠病毒共感染的潛在病原體。TRACE技術不同於繁瑣、耗時久的傳統RNA-seq建庫流程📁,所有步驟均在一個試管中完成🍋🟩,建庫總時長小於6小時🛻,操作時長不超過2小時,將原來需要數天完成的程序降低到半天;同時,TRACE技術能夠避免RNA材料的損失,縮小RNA起始量至納克級別🕤,降低建庫成本🐕🦺,實現了簡便🌙、快速、靈敏👨🏻🦳、高效的RNA建庫測序。TRACE技術可用於對鼻咽拭子、痰和糞便等樣本的建庫🛥,使得臨床樣品中新型冠狀病毒RNA基因組和共感染病原體宏基因組的檢測更為便捷,有望在臨床上為定製個性化診療策略提供幫助。

這項工作(“病毒基因組學測序技術在新型冠狀病毒研究中的應用”)的開展離不開國家和學校的支持以及團隊協作。該應急項目還包括中國科學院武漢病毒研究所劉翟課題組和武漢希望組的成員。此外🫒,南京諾唯贊生物科技有限公司為項目開展提供了關鍵試劑。目前,項目組已將該技術試用於臨床樣品的RNA文庫構建和病毒檢測,並將TRACE技術應用於首批病人咽拭子樣品的宏基因組測序。伊成器課題組正在利用臨床樣品進一步優化TRACE技術,以快速實現更多臨床樣品的共感染病原體的檢測和分析,為新冠感染者的臨床診治提供更多理論依據,助力疫情防控取得更多進展。